Deoksiriboza je 5-ogljikov monosaharid (pentoza), ki nastane iz riboze, ko izgubi en atom kisika. Empirična kemična formula za deoksiribozo je C5H10O4 in zaradi izgube atom kisika, se ne ujema s splošno formulo za monosaharide (CH2O) , kjer je n celo število.
fizikalne in kemijske lastnosti
Linearno formulo za deoksiribozo lahko predstavimo na naslednji način: H-(C=O)–(CH2)–(CHOH)3-H. Vendar pa obstaja tudi v obliki zaprtega obroča ogljikovih atomov.
Deoksiriboza je brezbarvna trdna snov, ki je brez vonja in je zelo topna v vodi. Njegova molekulska masa je 134,13 g/mol, tališče 91 °C. Pridobiva se iz riboza-5-fosfata zaradi delovanja ustreznih encimov med kemično reakcijo redukcije.
Razlika med ribozo in deoksiribozo
Kot že omenjeno in kot pove že ime, je deoksiriboza kemična spojina, katere atomska sestava se od riboze razlikuje le za en atom kisika. Kot je prikazanona spodnji sliki deoksiriboza nima hidroksilne skupine OH na svojem drugem ogljikovem atomu.
Deoksiriboza je del verige DNK (deoksiribonukleinska kislina), riboza pa del verige RNA (ribonukleinska kislina).
Zanimivo je, da sta monosaharida arabinoza in riboza stereoizomera, to pomeni, da se razlikujeta po prostorski razporeditvi glede na ravnino obroča skupine OH blizu 2. atoma ogljika. Deoksiarabinoza in deoksiriboza sta ista spojina, vendar se uporablja drugo ime, ker ta molekula izvira iz riboze.
Deoksiriboza in genetske informacije
Ker je deoksiriboza del verige DNK, igra pomembno biološko vlogo. DNK - vir genetskih informacij, je sestavljen iz nukleotidov, ki vključujejo deoksiribozo. Molekule deoksiriboze povezujejo en nukleotid z drugim v verigi DNK preko fosfatnih skupin.
Ugotovljeno je bilo, da odsotnost hidroksilne skupine OH v deoksiribozi daje mehansko fleksibilnost celotni verigi DNK v primerjavi z RNA, kar posledično omogoča molekuli DNK, da tvori dvojno verigo in je v kompaktni obliki znotraj celično jedro.
Poleg tega je zaradi prožnosti vezi med nukleotidi, ki jih tvorijo molekule deoksiriboze in fosfatne skupine, veriga DNK veliko daljša od RNA. To dejstvo omogoča kodiranje genetskih informacij z visoko gostoto.
