V prvih nekaj letih svojega obstoja si je država prizadevala, da bi bila priznana kot edina naslednica Jugoslavije, vendar so druge nekdanje sovjetske republike tem trditvam nasprotovale. Združeni narodi so zavrnili zahtevo po vključitvi Jugoslavije. Sčasoma je država po odstavitvi Slobodana Miloševića z mesta predsednika zveze leta 2000 opustila te težnje in sprejela mnenje Badinterjeve arbitražne komisije o skupnem nasledstvu. Ponovno je zaprosil za članstvo v ZN 27. oktobra in bil sprejet 1. novembra 2000.
ročno
ZRJ je sprva vladal Slobodan Milošević kot predsednik Srbije (1989-1997) in nato predsednik Jugoslavije (1997-2000). Milošević je namestil in izsilil odstavitev več zveznih predsednikov (kot je Dobrica Ćosić) in predsednikov vlad (kot je Milan Panić). Vendar je črnogorska vlada, ki je sprva goreče podpirala Miloševića, začela postopomadistancirati od njegove politike. To je povzročilo spremembo režima leta 1996, ko je njegov nekdanji zaveznik Milo Đukanović spremenil svojo politiko, postal vodja črnogorske vladajoče stranke in nato odstavil nekdanjega črnogorskega voditelja Momirja Bulatovića, ki je ostal zvest Miloševićevi vladi. Ker je bil od takrat Bulatović imenovan na osrednja mesta v Beogradu (kot zvezni predsednik vlade), je Đukanović še naprej vodil Črno goro in jo še dodatno izoliral od Srbije. Tako je od leta 1996 do 2006 Črna gora in Srbija sta bili nominalno ena država. Upravljanje v vseh možnih političnih, gospodarskih in družbenih segmentih je potekalo na lokalni ravni, v Beogradu za Srbijo in Podgorici za Črno goro.
Zveza Srbije in Črne gore
Kot ohlapna zveza ali konfederacija sta bili Srbija in Črna gora združeni le na določenih področjih, kot je obramba. Dve sestavni državi sta v celotnem obdobju obstoja Zvezne republike delovali ločeno in še naprej delovali v okviru ločene ekonomske politike ter z uporabo ločenih valut (evro je bil edino zakonito plačilno sredstvo v Črni gori). 21. maja 2006 je bil izveden referendum o neodvisnosti Črne gore, za neodvisnost pa je glasovalo 55,5 % volivcev. Zadnji ostanki nekdanje Jugoslavije, 88 let po nastanku, so se končali z uradno razglasitvijo neodvisnosti Črne gore 3. junija 2006 in uradno razglasitvijo neodvisnosti Srbije 5junija. Po razpadu je Srbija postala pravni naslednik unije, nova neodvisna Črna gora pa je ponovno zaprosila za članstvo v mednarodnih organizacijah.
Posledice katastrofe
Po razpadu Jugoslavije v 90. letih prejšnjega stoletja sta se le republiki Srbija in Črna gora strinjali, da bosta obdržali jugoslovansko državo in leta 1992 sprejeli novo ustavo za novo Jugoslavijo. Po propadu komunizma v Vzhodni Evropi je nova država sledila valu demokratičnih sprememb. Opustil je komunistične simbole: z državne zastave so odstranili rdečo zvezdo, komunistični grb pa je zamenjal beli dvoglavi orel z grbom Srbije in Črne gore v notranjosti. Nova država je ustvarila tudi enoosebno funkcijo predsednika, ki je bila sprva imenovana s soglasjem republik Srbije in Črne gore do leta 1997, nato pa je bil predsednik demokratično izvoljen.
Ustanovitev Zvezne republike Jugoslavije
Ob razpadu Jugoslavije in njenih institucij med letoma 1991 in 1992 se je postavilo vprašanje enotnosti dveh republik, ki sta ostali v razpadajoči federaciji: Srbije in Črne gore; pa tudi na ozemljih s srbsko večino na Hrvaškem in v Bosni, ki so želeli ostati združeni. Leta 1991 so se kot rezultat diplomatskih pogajanj pod vodstvom lorda Carringtona s šestimi voditelji vse republike, razen Srbije, strinjale, da je Jugoslavija razpadla in da mora vsak njen avtonomni del postati samostojna država. Srbska vlada je bila presenečena in ogorčena nad odločitvijo Črne gore za konecJugoslavija, saj je bila Bulatovičeva vlada prej tesno povezana z Miloševićevo vlado v Srbiji. Razpad Jugoslavije se je začel leta 1991, ko so Slovenija, Hrvaška in Makedonija razglasile neodvisnost. Nato je nastala Zvezna republika Jugoslavija.
Tretja Jugoslavija
26. decembra 1991 so se Srbija, Črna gora in srbska uporniška ozemlja na Hrvaškem dogovorile, da bodo oblikovale novo "tretjo Jugoslavijo". Tudi leta 1991 so si prizadevali za vključitev Socialistične revolucionarne Bosne in Hercegovine v federacijo, kjer potekajo pogajanja med Miloševićem, Srbsko demokratsko stranko BiH in zagovornikom združitve Bošnjakov, podpredsednikom BiH Adilom Zulfikarpašićem. Zulfikarpašić je menil, da bi združitev s Srbijo in Črno goro koristila Bosni, zato je podpiral zavezništvo, ki bi zagotovilo enotnost Srbov in Bošnjakov. Zastava Zvezne republike Jugoslavije se ni v ničemer razlikovala od države predhodnice.
Milošević je nadaljeval pogajanja z Zulfikarpašičem o vključitvi Bosne v novo Jugoslavijo. Vendar so prizadevanja za vključitev celotne Bosne v novo Jugoslavijo dejansko zamrla do konca leta 1991, ko je Izetbegović nameraval izvesti referendum o neodvisnosti, medtem ko so bosanski Srbi in bosanski Hrvati oblikovali avtonomna ozemlja.
Spor med bratskimi ljudstvi
Od leta 1996 so prvi javni znaki političnega nesoglasja meddel črnogorskega in srbskega vodstva. Do leta 1998, ko je črnogorski premier Milo Đukanović prišel v ospredje v boju za oblast s črnogorskim predsednikom Momirjem Bulatovićem, je republika vodila drugačno ekonomsko politiko in za svojo valuto sprejela nemško marko. Jeseni 1999, po vojni na Kosovu in Natovi bombni kampanji, je Đukanović (ki je bil do zdaj trdno držal oblast v Črni gori kot Bulatović popolnoma odstavljen) pripravil osnutek dokumenta z naslovom Platforma za redefiniciju odnosa Crne Gore Srbije. Republika Jugoslavija ), ki poziva k večjim spremembam v delitvi upravnih pristojnosti znotraj SR Jugoslavije, čeprav še vedno uradno vidi Črno goro kot skupno državo s Srbijo. Milošević se na platformo ni odzval, saj je ocenil, da je neustavna.
Naraščajoča napetost
Politični odnosi v zvezni državi so postajali vse bolj napeti, zlasti v ozadju vala atentatov na vrhunske politične, kriminalne in državne poslovneže v obeh republikah (Željko "Arkan" Rožnatović, Pavle Bulatović, Čika Petrović in Goran Žugić), pa tudi dva atentata na opozicijskega politika Vuka Draškovića. Do oktobra 2000 je Milošević izgubil oblast v Srbiji. V nasprotju s pričakovanji se Đukanovićan na zamenjavo oblasti v Beogradu ni odzval, da bi še dodatno porinil agendo iz njegove »Platforme«, ampak da bi se nenadoma začel zavzemati za popolno neodvisnost, s čimerga v procesu popolnoma zavržete. Naslednje vlade Črne gore so se zavzemale za osamosvojitveno politiko, politične napetosti s Srbijo pa so kljub političnim spremembam v Beogradu tlele. Vse te strasti so bile naravna posledica zgodovine nastanka ZR Jugoslavije.
Ustanovitev konfederacije
Leta 2002 sta Srbija in Črna gora sklenili nov dogovor o nadaljevanju sodelovanja, ki je med drugimi spremembami obetal konec Jugoslavije. Obe državi sta bili prej del Zvezne republike Jugoslavije. Zvezna skupščina Jugoslavije je 4. februarja 2003 ustanovila svobodno državno skupnost oziroma konfederacijo Državno skupnost Srbije in Črne gore. Dosežen je bil dogovor o novi ustavni listini, ki bi zagotovila osnovo za upravljanje države.
Neodvisnost Črne gore
V nedeljo, 21. maja 2006, so Črnogorci glasovali na referendumu o neodvisnosti. 55,5 % jih je podprlo neodvisnost. Toliko glasov "za" je bilo potrebno za razpad Jugoslavije. Volilna udeležba je bila 86,3 % in 99,73 % od več kot 477.000 oddanih glasov je bilo veljavnih.
Naslednja razglasitev neodvisnosti Črne gore (junija 2006) in Srbije (5. junija) je končala konfederacijo Jugoslavije in s tem zadnje preostale ostanke Zvezne republike.
Gospodarski razvoj Zvezne republike Jugoslavije
Država je močno ekonomsko trpela zaradi propada in neučinkovitega upravljanja gospodarstva, intudi podaljšano obdobje gospodarskih sankcij. V začetku devetdesetih let prejšnjega stoletja je ZRJ trpela zaradi hiperinflacije jugoslovanskega dinarja. Do sredine devetdesetih let prejšnjega stoletja je ZRJ premagala inflacijo. Nadaljnja škoda na jugoslovanski infrastrukturi in industriji, ki jo je povzročila kosovska vojna, je pustila gospodarstvo le polovico manjše kot leta 1990. Po odstavitvi nekdanjega predsednika zvezne Jugoslavije Slobodana Miloševića oktobra 2000 je koalicijska vlada Demokratske opozicije Srbije (DOS) izvedla stabilizacijske ukrepe in začela z agresivno agendo tržnih reform. Po ponovnem članstvu v Mednarodnem denarnem skladu decembra 2000 se je Jugoslavija nadaljevala z reintegracijo s preostalim svetom, tako da se je pridružila Svetovni banki in Evropski banki za obnovo in razvoj.
Majša republika Črna gora je v času Miloševića svoje gospodarstvo ločila od zveznega nadzora in od Srbije. Kasneje sta imeli republiki ločeni centralni banki, Črna gora pa je začela uporabljati različne valute: najprej je prevzela blagovno znamko Deutsch in jo uporabljala, dokler ni propadla in jo nadomestil evro. Srbija je še naprej uporabljala jugoslovanski dinar in ga preimenovala v srbski dinar.
Zapletenost političnih odnosov v ZRJ, počasen napredek pri privatizaciji in stagnacija v evropskem gospodarstvu so prizadeli gospodarstvo. Dogovori z MDS, zlasti zahteve po finančni disciplini, so bili pomembni elementi oblikovanja politike. Resna brezposelnost je bilaključno politično in gospodarsko vprašanje. Korupcija je tudi velika težava z velikim črnim trgom in visoko stopnjo kriminalne vpletenosti v formalno gospodarstvo.