V biologiji je za opis določenega organizma, ki spada v kraljestvo živali, gliv ali rastlin, razvita njegova lastna nomenklatura. Odraža pripadnost eni vrsti, odvisno od značilnosti morfologije in videza. Za živali se uporabljajo merila za sklicevanje na vrsto, odvisno od zmožnosti tvorbe plodnih potomcev med oploditvijo. Vendar ti vzorci veljajo samo za te organizme, medtem ko mikrobov ni mogoče razvrstiti na ta način.
Koncept seva v mikrobiologiji
Zaradi prisotnosti velikega števila organizmov, ki imajo morfološke lastnosti, vendar različne biokemične in imunološke lastnosti, je nemogoče uporabiti standardno nomenklaturo za poimenovanje. Posledično je bil uveden tak koncept, kot je sev. To je čista kultura mikrobov, ki je bila izolirana in izolirana na določenem mestu ob določeni uri.
Vsak mikrob, ki pripada enemu sevu, je po biokemičnih, morfoloških, imunoloških in genetskih kriterijih podoben drugemu takemu predstavniku. Toda znotraj iste bakterijske vrste taka analogija ni opažena. Zato je sev bolj prilagodljivo ime za mikrobno kulturo. Ker hitroizmenjava genskega materiala (mutacija) vodi do nastanka novih organizmov znotraj vrste, vendar z različnimi lastnostmi, prav ta definicija nam omogoča natančnejšo karakterizacijo dejavnikov patogenosti in virulence.
bakterijski sevi
Obstoječa nomenklatura bakterij omogoča razvrščanje vrst organizmov, vendar ne označuje njihovih novih lastnosti. Slednji se pojavijo kot posledica hitre mutacije, ki pridobiva nove lastnosti, vključno s tistimi, ki so patogene za ljudi, domače živali in rastline ter druge mikrobe. Primer nomenklature na primeru Escherichia coli je videti takole: kraljestvo - bakterije, vrsta - Proteobacteria, razred gama-proteobakterij, vrstni red - Enterobacteriales, družina Enterobacteria. Rod je Escherichia, vrsta pa Escherichia colli. Vendar pa obstaja veliko kultur bakterij vrste Escherichia colli, ki kažejo različne lastnosti. Izolirani so v ločene seve bakterij in imajo dodatno ime. Na primer, Escherichia colli O157:H7.
E. coli je sama prisotna v človeškem črevesju in ne povzroča bolezni, vendar je sev O157:H7 izključno patogen zaradi prisotnosti velikega števila dejavnikov virulence. V zadnjih 5 letih je doživela epidemijo enterotoksigenih bolezni.
Sevi virusov
Koncept seva je prilagodljivo ime za organizme z enakimi lastnostmi, ki so bili izolirani, nato identificirani in opisani na določenem območju ob določenem času. S svojim potekom lahko virus zaradi antigena pridobi nove lastnostidrift. To bo ustvarilo nov virusni sev, morda bolj patogen kot njegov starš.
Pojav novih sevov lahko jasno prikažete na primeru virusa gripe. Spada v družino ortomiksovirusov in je poimenovan glede na antigene (hemaglutinini in nevraminidaza) HxNy. X in Y sta številčni vrednosti, ki odražata prisotnost antigenov. Primer je H5N1, znan po nedavni epidemiji prašičje gripe s hitro napredujočimi hemoragičnimi pljučnicami. Po teoriji se lahko iz tega seva razvije nov in nevarnejši sev zaradi enakega antigenskega drifta.
Gljivični sevi in protistični sevi
Plesni so najmanj spremenljive od vseh mikrobov, čeprav je tudi njihova biokemija zapletena. Zaradi kompleksnejše strukture kot bakterije in virusi ter tudi zaradi pomanjkanja mehanizmov za hiter prenos genov se število novih sevov gliv nekoliko poveča. Obstaja tudi mnenje, da je vsak na novo odkrit sev gliv že obstoječi organizem, ki ga raziskovalci preprosto niso srečali.
Podobna situacija obstaja v kraljestvu protistov. Njihova sposobnost mutiranja je majhna, zato je verjetnost, da se bodo novi sevi hitro pojavili, izjemno majhna. Vendar se še vedno pojavljajo nove različice organizmov iste vrste. Zato so očitno obstajali tudi prej, vendar jih niso odkrili.
